Broad Institute는 Google 엔지니어링 및 Intel 최적화를 통해 새로운 수준의 연구를 가능하게 합니다.

새로운 소식:  게놈 연구를 가속화하기 위해 Intel 및 Google Cloud와 지속적으로 협력한 결과, MIT 및 Harvard의 Broad Institute는 빠르고 비용 효율적인 Google N1 및 N2 인스턴스를 위해 워크플로를 최적화했습니다. Google Cloud의 초기 워크로드 배포와 비교하여 협업을 통해 최적화 1 후 데이터 처리 비용이 85% 절감되었습니다 .

"우리는 클라우드가 완전히 새로운 수준의 데이터 연합 및 협업을 가능하게 한다는 것을 알고 있었고 다른 사람들과 협력하여 클라우드 기반 데이터 에코시스템을 만들 수 있었습니다. 여기에서 연구원들은 다른 데이터 세트로 생성한 데이터보다 더 많은 데이터에 대한 워크플로를 더 풍부한 데이터로 결합할 수 있습니다. , 더 강력한 계산 실험." – Geraldine Van der Auwera, MIT 및 하버드 브로드 인스티튜트 아웃리치 및 커뮤니케이션 담당 데이터 과학 플랫폼 이사

 

작동 원리:  유전체학 데이터 생성 및 계산 연구 수요의 급격한 증가에 적응하기 위해 Broad Institute는 워크로드를 Google Cloud N2 인스턴스로 마이그레이션했습니다. 파이프라인 워크플로를 모듈화하고 워크로드의 요구 사항에 따라 클라우드 인스턴스의 크기를 적절하게 조정하고 Intel® Xeon® Scalable 프로세서에 맞게 최적화함으로써 Broad Institute 사용자는 GCP에서 유전체학 워크플로를 약 25% 더 빠르고 34% 더 저렴한 비용으로 실행할 수 있습니다. Xeon 확장 가능 프로세서가 있는 N2 인스턴스에 배포 1 .

Intel은 2017년부터 Broad Institute와 파트너십을 맺어 Intel® Genomics Kernel Library를 비롯한 Intel 라이브러리로 연구소의 파이프라인 및 GATK(Genome Analysis Toolkit)를 최적화하는 데 도움을 주었습니다. 그들은 또한 전 세계의 연구원과 소프트웨어 엔지니어가 과학자들이 게놈 데이터를 통합하고 처리하는 데 도움이 되는 새로운 도구와 인프라를 구축, 최적화 및 널리 공유할 수 있도록 하는 프로젝트인 Intel-Broad Center for Genomic Data Engineering을 관리합니다.

Intel은 Broad Institute와 협력하여 Google Cloud에서 파이프라인을 최적화하는 데 도움을 주었습니다. 예를 들어 Genome Analytics Toolkit의 특정 커널은 Intel® Advanced Vector Extensions 512(Intel® AVX-512)를 사용한 벡터 작업에 최적화되어 있습니다. 일부 최적화된 스토리지 기능은 인텔® 지능형 스토리지 가속 라이브러리(인텔® ISA-L)를 사용합니다.

더 넓은 생명 과학 생태계 비전을 실현하기 위해 Broad Institute, Microsoft 및 Verily는 전 세계의 생물 의학 연구원이 데이터에 액세스하고, 분석 도구를 실행하고, 협업할 수 있는 확장 가능하고 안전한 플랫폼인 Terra 플랫폼을 공동 개발했습니다. Terra는 클라우드 인프라를 기반으로 구축되어 Broad Institute가 쉽게 확장하고 연구 커뮤니티에 인간 질병에 대한 솔루션 연구를 위한 새로운 기능을 제공할 수 있도록 합니다.

중요한 이유:  유전체학은 생물학이 수행되는 방식을 변경했습니다. Intel 및 Google Cloud의 도움으로 Broad Institute는 혁신의 최전선에서 게놈 연구를 지원하고 지원합니다. Broad Institute는 클라우드로 마이그레이션하고 Google Cloud 인스턴스에 대한 워크로드를 최적화함으로써 확장 가능하고 미래 지향적인 방식으로 스토리지 용량 및 컴퓨팅 기능 문제를 해결했습니다. Terra 플랫폼을 공동 구축함으로써 Broad Institute는 연구 팀뿐만 아니라 전 세계의 생명 과학자들에게 권한을 부여하여 이러한 최적화된 도구와 파이프라인을 활용하고 많은 흥미로운 생물 의학 연구의 새로운 가능성.

추가 컨텍스트:  Intel 및 Google Cloud 팀 모두와 함께하는 연구 프로그램

인텔 파트너 사례:  Intel.com의 인텔 고객 집중 조명  | 인텔 뉴스룸의 파트너 스토리

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1  https://terra.bio/speed-up-your-workflows-with-n2-instances-sporting-intels-2nd-generation-xeon-cpus/

고지 및 면책 조항:  성능은 사용, 구성 및 기타 요인에 따라 다릅니다. www.Intel.com/PerformanceIndex 에서 자세히 알아보십시오  . 성능 결과는 구성에 표시된 날짜의 테스트를 기반으로 하며 공개적으로 사용 가능한 모든 업데이트를 반영하지 않을 수 있습니다. 구성 세부 정보는 백업을 참조하십시오. 어떤 제품이나 구성 요소도 절대적으로 안전할 수 없습니다. 비용과 결과는 다를 수 있습니다. 인텔은 제3자 데이터를 통제하거나 감사하지 않습니다. 정확성을 평가하려면 다른 출처를 참조해야 합니다.

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